Jako improwizator specjalizuje się w akompaniowaniu niemych filmów na organach i fortepianie. W Filharmonii Opolskiej zagrał do niemego filmu z 1925 roku. Film był emitowany z polskimi napisami.

- Często gram muzykę filmową i lubię grać do niemych filmów - dodaje artysta.

- Ja bardzo często w ten sposób występuję, zwłaszcza w salach koncertowych, ale też i w kościołach. Dzięki takiemu wydarzeniu, możemy przyciągnąć właściwie na koncert organowy publiczność, która z organami nie ma nic wspólnego. Bardzo często gram na festiwalach filmowych, gdzie rzeczywiście pośród publiczności siedzą sami filmowcy, niezwiązani wcale z muzyką. Zawsze jest to pozytywnie przyjmowane. Pomysł muzyki do "Upiora w Operze" narodził się bardzo szybko, bo znam ten instrument, grałem tu bodajże trzy lata temu.

W 2017 roku ukazała się nowa wersja filmu Męczeństwo Joanny d'Arc Carla Theodora Dreyera z 1928 roku z muzyką improwizowaną przez Mossakowskiego.

Karol Mossakowski prowadzi obecnie klasę organów i improwizacji w Konserwatorium im. Hectora Berlioza w Paryżu. Jest również organistą tytularnym katedry w Lille we Francji.